Una vez frustrados los lunáticos planes del Dr. Wily para dominar el mundo, la paz reina de nuevo. Pero el Dr. Wily ha creado en secreto otros ocho superpoderosos robot masters. Ahora que estos malvados humanoides andan sueltos por el mundo, ¿estará Mega Man a la altura del desafío y podrá volver a pararle los pies al Dr. Wily?